区别在于GPC是凝胶渗透色谱，又称为尺寸排阻色谱，它是基于体积排阻的分离机理，通过具有分子筛性质的固定相，用来分离相对分子质量较小的物质，并且还可以分析分子体积不同、具有相同化学性质的高分子同系物。GPC应该是液相色谱的一个分支，是一款在处理大分子物质以及高聚物的理想设备之一。在对各类食品、农产品、水产品中的农残、半挥发性有机物分析时，在有机样品萃取物中一般会含有大分子物质，如果不去除这些物质，则导致色谱柱分离效率降低、进样口和色谱柱的使用寿命缩短，进而影响数据分析结。因此，在农残、半挥发性有机物的样品分析前必须进行有效的净化前处理。而HPSEC是高效分子排阻色谱法。国际标准分类中，hpsec高效空间排阻色谱法涉及到食用油和脂肪、含油种子。在中国标准分类中，hpsec高效空间排阻色谱法涉及到油脂加工与制品。
